Yayasan Perguruan Tiga Bukit  yang di Prakarsai oleh Bapak Syamsudin Limbong/br Manungkalit  kepada Bapak N. Limbong/br Tupang dan T. Limbong/br Purba melihat dari kondisi serta Mutu Pendidikan anak didaerah tersebut yang sagat memprihatinkan dimana anak-anak harus menjangkau sekitar 4 - 10 Km untuk mendapatkan fasilitas pendidikan dari pemerintah hingga akhirnya mereka mempelajari, melakukan riset sampai menemukan suatu titik permasalahan apa sebenarnya yang dialami oleh masyarakat sekitarnya sehingga anak-anak negeri itu tidak bisa sekolah.

Dengan berbagai pedoman mereka memberikan suatu kesimpulan dan mengaplikasikan apa yang ada dibenak mereka demi peningkatan, kemajuan dan pemberdayaan masyarakat di daereah pedesaan maka pada tahun 1990 didirikanlah sebuah sekolah dan diberi Nama Yayasan Perguruan Tiga Bukit dimana pertama sekali program yang dijalankan adalah SMP Swasta Tiga Bukit yang diambil Namanya berdasarkan SMP Negeri 3 Medan tempat tugas dari Istri Bpk. Sy. Limbong boru Manungkalit.